Objectifs du projet

. Objectifs scientifiques :
-Apprentissage et maîtrise des logiciels en lignes utilisés pour l’annotation des génomes
-Exploration des voies métaboliques des microorganismes via une annotation fonctionnelle de leurs génomes
-Annotation relationnelle des génomes cibles et détermination des gènes paralogues et orthologues ainsi que les groupes de synthenie afin de retracer l’histoire évolutive de ces gènes et de leurs produits.
2. Objectifs techniques :
-Extractions et traitements des données disponibles au niveau des bases de données et plates-formes d’annotation des génomes complets de Procaryotes et d’Archaebactéries
-Création de notre propre banque de données qui sera nommée BDZYM (Banque de Données des enzymes) comprenant des séquences génomique et protéiques`de tout les Bactéries et Archaebactéries
-décrire, comprendre, et prédire les fonctions des génomes cibles
3. Objectifs technologiques :
-Mise en place d’un réseau locale de bioinformatique utilisant des bases de données et plates formes d’annotation des génomes complets de Procaryotes et d’Archaebactéries.
-Mettre à la disposition des étudiants, des chercheurs et par la suite aux industrielles de nouvelles séquences codants pour de nouvelles activités enzymatiques.
4. Objectifs socio-économiques et de formation :
-Construction sur site d’une unité de recherche et de production de nouvelles activités enzymatiques ; ce qui va contribuer à promouvoir l’activité économique dans la région et créer de nouveaux emplois
-Encadrement des étudiants (licence, master, ingénieur, magister et doctorat).

Mots clés

Bioinformatique, Réplicon, RBS, Génomique, CDS, AFC, Protéomique, Plate-forme, gènes orthologues, Annotation, Enzymes, gènes paralogues